SD Ar Rafi' Drajat memiliki visi bahwa lulusan Ar Rafi' Drajat adalah Abdullah dengan tugas sebagai Khalifah. Oleh karena itu, misi Ar Rafi' adalah menumbuhkembangkan nilai-nilai akidah sesuai Al-Qur'an dan Sunnah, mengembangkan manajemen pembelajaran berbasis teknologi dan wawasan internasional yang berkompetensi luas berlandaskan paradigma akidah. Sosok calon pemimpin dalam abad ke-21 adalah mereka yang merupakan bagian integral dari masyarakat ilmiah (scientific society) dan masyarakat belajar (learning society). Abad ke-21 ditandai oleh terjadinya globalisasi akibat dari revolusi teknologi, informatika, dan komunikasi. Oleh karena itu, sejak berdirinya SD Ar Rafi' Drajat, teknik informatika dan komunikasi bukan suatu mata pelajaran melainkan prasyarat yang harus dikuasai siswa dalam mempelajari semua disiplin ilmu serta penggunaannya dalam kehidupan berintikan nilai-nilai iman kepada Allah Swt..